雙導師共同指導在職研究生，還存在一個導師的責任和溝通問題。由于兩位導師分別負責在職研究生培養的不同環節，并且在不同單位，缺乏日常交往，如果導師不能明確各自職責并具備高度的責任感，容易出現溝通不暢、信息不靈等問題，造成在職研究生在理論與實踐培養環節上的脫節，從而影響到人才培養的質量。因此，在雙導師制培養方式中，校內導師、校外導師都應積極主動，加強交流。例如，由學校導師定期組織學術報告邀請企業導師參加，或者一企業導師邀請學校導師到單位進行實際考察等，使雙方進一步了解對方的培養方法，避免培養環節中出現真空地帶。這樣，才能產生期望的理想效果，才能幫助藥學專業的學生提高學習和實踐能力。如果有一方認識不足或積極性不夠，就會使雙導師制實施受到阻礙而流于形式。